Le métabolome circulant : un nouvel outil pour analyser la relation entre hôte et tumeur
- L'évaluation qualitative et quantitative des métabolites circulants chez les patients atteints d'un cancer apparaît comme un outil intéressant pour étudier les caractéristiques spécifiques du microenvironnement tumoral ainsi que les modifications du métabolisme des patients. Les métabolites circulants sont les produits de la reprogrammation métabolique des cellules cancéreuses et se combinent avec la réponse de l'hôte contre le cancer (interaction entre hôte et tumeur).
- Plusieurs études ont utilisé la métabolomique sur du plasma ou du sérum de patients atteints de cancer. Des voies métaboliques perturbées ont été décrites dans de nombreux cancers, avant et pendant les traitements. Les signatures métaboliques systémiques peuvent ainsi servir de biomarqueurs pronostiques, mais pourraient également être considérées comme un outil pharmacodynamique. Cependant, à cause de l'hétérogénéité importante de tous ces résultats, la métabolomique reste exploratoire.
Liens d'interêts
Les auteurs déclarent ne pas avoir de liens d’intérêts.
auteur
Dr Olivier TRÉDAN
Médecin
Oncologie
Centre Léon-Bérard, Lyon
France
Contributions et liens d'intérêts
- centre(s) d’intérêt
-
Oncologie générale,
Onco-théranostic
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Figure 1. Représentation schématique des principales perturbations métaboliques du microenvironnement tumoral.
Figure 2. Représentation schématique des principales voies métaboliques modifiées au sein d’une cellule cancéreuse (d’après DeBerardinis RJ et al. Cell Metab 2008;7:11-20).
Figure 3. Représentation schématique des principaux métabolites augmentés (en rouge) ou diminués (en bleu), après 7 semaines de traitement par inhibiteur de mTOR (21).
| Techniques | Caractéristiques | |
|---|---|---|
| RMN (résonance magnétique nucléaire) |
• Non destructive • Peut être entièrement automatisée • Haut degré de reproductibilité • Préparation minimale des échantillons • Sensibilité faible (par rapport à la MS) • Difficulté pour analyser les spectres de mélanges complexes • Instruments coûteux |
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| MS (spectrométrie de masse) |
GC-MS (chromatographie gazeuse) |
• Relativement peu coûteuse • Degré élevé de sensibilité • Préparation de l’échantillon longue • Applicable aux composés susceptibles d’être vaporisés par chauffage |
| LC-MS (chromatographie liquide) |
• Temps de préparation de l’échantillon moins long que pour la GC-MS • Reproductibilité dépendante de LC • Sensibilité variable (peut souffrir de la suppression d’ions, et dépendante de la cinétique des métabolites et de leur hydrophobicité) • Plus coûteuse que la GC-MS |
|
| CE-MS (électrophorèse capillaire) |
• Pouvoir de résolution élevé • De très petits échantillons suffisent • Technique rapide • Utilisée pour le profilage simultané de différentes classes de métabolites |
|
| FT-IR (spectroscopie infrarouge à transformée de Fourier) |
• Non destructive et simple à mettre en œuvre • Peu onéreuse et adaptée pour le criblage à haut débit • Peu sensible et peu discriminante |
|
