Quelles analyses à la progression sous ITK de l'EGFR ?
- Les mutations activatrices de l'EGFR sont le marqueur prédictif de réponse aux ITK de l'EGFR. Pour les patients dont la tumeur est porteuse d'une mutation commune de l'EGFR (del 19, L858R), le traitement actuel de 1re ligne est un ITK de 3e génération, l'osimertinib. Dans les situations où un ITK de 1re ou de 2e génération est donné en 1re ligne, l'osimertinib peut être prescrit en 2e ligne en présence d'une mutation de résistance T790M de l'EGFR. En dépit d'un excellent contrôle de la maladie sous ITK de l'EGFR, la résistance aux traitements est inéluctable, posant la question des mécanismes biologiques de la résistance. L'identification de ces mécanismes a pour objectif de détecter de potentielles nouvelles cibles thérapeutiques, qui peuvent être différentes selon la génération d'ITK et la ligne thérapeutique. À côté des mécanismes EGFR-dépendants (mutations secondaires/tertiaires, amplification), des mécanismes alternatifs EGFR-indépendants peuvent être mis en évidence comme des mutations, amplifications ou fusions d'autres gènes. Ces mécanismes peuvent être mis en évidence via des stratégies d'analyse dépendant des techniques de biologie moléculaire et des échantillons biologiques analysés. La transformation histologique est un autre mécanisme de résistance avec des biomarqueurs prédictifs et la nécessité d'un échantillon tissulaire pour faire le diagnostic. La place de la biopsie liquide dépend de la génération ou de la ligne d'ITK utilisée et permet d'envisager un monitoring moléculaire.
Liens d'interêts
M. Beau-Faller déclare avoir des liens d’intérêts avec AstraZeneca, Pfizer et Amgen.
D. Reita déclare avoir des liens d’intérêts avec ArcherDx.
E. Pencreach et E. Guérin n’ont pas précisé leurs éventuels liens d’intérêts.
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Quelles analyses à la progression sous ITK de l’EGFR ? - Figure 1
Figure 1. Mutations des exons 18 à 21 du gène EGFR (en acides aminés) dans les cancers bronchiques non à petites cellules, selon la génération d’ITK-EGFR et la ligne thérapeutique.
Quelles analyses à la progression sous ITK de l’EGFR ? - Figure 2
Figure 2. Mécanismes de résistance selon la génération d’ITK-EGFR et la ligne thérapeutique.
Quelles analyses à la progression sous ITK de l’EGFR ? - Figure 3
Figure 3. Voies de signalisation et mécanismes de résistance acquise sous ITK-EGFR.
Quelles analyses à la progression sous ITK de l’EGFR ? - Figure 4
Figure 4. Algorithme de détection des mécanismes de résistance, selon la génération d’ITK-EGFR et la ligne thérapeutique.
Tableau. Techniques de biologie moléculaire réalisées à la résistance sous ITK-EGFR.
ADNtc : ADN tumoral circulant ; C : clinique ; CNV : copy number variation ; dPCR : digital PCR ; Exp : expression ; FFPE : formalin-fixed paraffin-embedded ; LoD : limite de détection ; M : mutation ; NGS : next generation sequencing ; R : recherche ; Trsl : translocation de gènes ; WES : whole exome sequencing ; WGS : whole genome sequencing ; WTS : whole transcriptome sequencing.
| Stratégie multiplex, sans a priori, NGS | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Technique | LoD | Type d’échantillon | M | CNV | Trsl | Exp | Utilisation |
| Haut débit | |||||||
| WGS-WES | 5 % | Congélation | XX | R | |||
| WTS-RNAseq | 5 % | Congélation | XX | X | R | ||
| NGS ciblé | |||||||
| ADN | |||||||
| FoundationOne® CDx | 2-5 % | FFPE | XX | (X) | X | R, C | |
| FoundationOne® Liquid CDx® | 0,2-1 % | ADNtc | XX | (X) | X | R, C | |
| Guardant360® assay | 0,2-0,4 % | FFPE, ADNtc | XX | (X) | X | R, C | |
| Panels ciblés élargis | 2-5 % | FFPE, ADNtc | XX | (X) | C | ||
| ARN | |||||||
| TruSight RNA Fusion Panel® (Illumina) | 10-15 % | FFPE | X | XX | X | C | |
| Targeted RNAscan custom® (Qiagen) | 10-15 % | FFPE | X | XX | X | C | |
| Oncomine® Focus (Thermo Fisher) | 10-15 % | FFPE | X | XX | X | C | |
| FusionPlex® kit (ArcherDx) | 10-15 % | FFPE | X | XX | X | C | |
| Méthodes ciblées | |||||||
| Technique | LoD | Type d’échantillon | M | CNV | Trsl | Exp | Utilisation |
| NanoString® | 10 000 copies | FFPE | X | X | X | R | |
| Real-time PCR (Cobas®, Therascreen®) | 1-5 % | FFPE, ADNtc | X | X | C | ||
| Idylla® | 5 % | FFPE, ADNtc | X | C | |||
| MassARRAY® | 1-2 % | FFPE, ADNtc | X | C | |||
| dPCR | 0,1-0,01 % | FFPE, ADNtc | X | X | R, C | ||
ADNtc : ADN tumoral circulant ; C : clinique ; CNV : copy number variation ; dPCR : digital PCR ; Exp : expression ; FFPE : formalin-fixed paraffin-embedded ; LoD : limite de détection ; M : mutation ; NGS : next generation sequencing ; R : recherche ; Trsl : translocation de gènes ; WES : whole exome sequencing ; WGS : whole genome sequencing ; WTS : whole transcriptome sequencing.
