Dossier

Métagénomique clinique en 2021 : état des lieux et perspectives

Mis en ligne le 31/12/2021

Auteurs : M. Salmona, C. d’Humières, E. Ruppé

  • La métagénomique clinique (MgC) est une méthode de diagnostic microbiologique basée sur le séquençage à haut débit.
  • La MgC permet de détecter l'ADN ou l'ARN de micro-organismes, quelle que soit leur nature (bactéries, virus, levures, champignons, parasites).
  • La MgC manque cependant de sensibilité, notamment dans les échantillons complexes et riches en cellules humaines (interférence avec l'ADN humain).
  • La MgC est également très sensible aux contaminations, notamment dans les échantillons dépourvus de micro-organismes (vrais négatifs).
  • La MgC est aujourd'hui une méthode prometteuse pour compléter, et non remplacer, les méthodes conventionnelles.
Liens d'interêts

M. Salmona et C. d’Humières déclarent ne pas avoir de liens d’intérêts en relation avec cet article.

E. Ruppé déclare avoir des liens d’intérêts avec les sociétés PathoQuest et Illumina (consultant).

auteur
Dr Étienne RUPPÉ

Médecin
Biologie médicale
Hôpital Bichat, Paris
France
Contributions et liens d'intérêts

centre(s) d’intérêt
Infectiologie
thématique(s)
Diagnostic
Mots-clés